内科学系全体で協力し合って教育・診療・研究の運営に携わっています。内科学系の運営方針は、毎月開催される内科学系運営会議において、学系長、各領域主任、ならびに内科学系の各部会（総務部会・財務部会・研究推進部会・広報部会・内科活性化部会・研修委員会）の委員長を中心とする話合いで決定され、その方針に基づいて各部会が中心となって活動します。活動の一環として、各領域の医師全員が参加する内科総会を1〜2ヶ月に1回開催し、若手医師の研究成果報告や、領域をまたがる症例についての検討などを活発に行っています。また、内科総会では、内科学系運営会議の報告も行うと同時に、内科医師全員で双方向の情報交換を行っており、若手医師の意見を積極的に内科学系の方針決定に活用するようにしています。